| ESCUELA DE EDUCACION BASICA CAUPOLICAN MARIN | Bella Vista | — | Ordinario | 244 |
| ESCUELA DE EDUCACION BASICA JULIO HUMBERTO PUEBLA CASTELLANOS | Bella Vista | — | Ordinario | 16 |
| UNIDAD EDUCATIVA TOMAS DE BERLANGA | Bella Vista | — | Ordinario | 182 |
| ALEJANDRO HUMBOLDT | El Progreso | — | Ordinario | 3 |
| ESCUELA DE EDUCACION BASICA CARLOS DARWIN | El Progreso | — | Ordinario | 77 |
| UNIDAD EDUCATIVA LICEO NAVAL GALAPAGOS | El Progreso | — | Ordinario | 306 |
| UNIDAD EDUCATIVA AMAZONAS | Isla Santa Maria Floreana | — | Ordinario | 32 |
| COLEGIO PARTICULAR A DISTANCIA ISLAS GALAPAGOS | Puerto Ayora | — | Popular Permanente | 32 |
| DON BOSCO GALAPAGOS | Puerto Ayora | — | Popular Permanente | 239 |
| ESCUELA DE EDUCACION BASICA GALO PLAZA LASSO | Puerto Ayora | — | Ordinario | 664 |
| ESCUELA DE EDUCACION BASICA OSWALDO GUAYASAMIN | Puerto Ayora | — | Ordinario | 494 |
| MARIA MONTESSORI | Puerto Ayora | — | Ordinario | 50 |
| MARIA MONTESSORI | Puerto Ayora | — | Ordinario | 12 |
| UNIDAD EDUCATIVA LOMA LINDA | Puerto Ayora | — | Ordinario | 375 |
| UNIDAD EDUCATIVA COMUNITARIA INTERCULTURAL BILINGUE RUNAKUNAPAK YACHAY | Puerto Ayora | — | Ordinario | 144 |
| UNIDAD EDUCATIVA ESPECIALIZADA GALAPAGOS | Puerto Ayora | — | Educación Especial | 29 |
| UNIDAD EDUCATIVA MIGUEL ANGEL CAZARES | Puerto Ayora | — | Ordinario | 545 |
| UNIDAD EDUCATIVA NACIONAL GALAPAGOS | Puerto Ayora | — | Ordinario | 556 |
| UNIDAD EDUCATIVA SAN FRANCISCO DE ASIS | Puerto Ayora | — | Ordinario | 1,226 |
| COLEGIO PARTICULAR A DISTANCIA DR JAIME ROLDOS AGUILERA | Puerto Baquerizo Moreno | — | Popular Permanente | 147 |
| DON BOSCO DEL GUAYAS | Puerto Baquerizo Moreno | — | Popular Permanente | 57 |
| ESCUELA DE EDUCACION BASICA EUREKA | Puerto Baquerizo Moreno | — | Ordinario | 7 |
| ESCUELA DE EDUCACION BASICA NEWTON GALAPAGOS | Puerto Baquerizo Moreno | — | Ordinario | 28 |
| EUGENIO ESPEJO | Puerto Baquerizo Moreno | — | Ordinario | 4 |
| PEDRO PABLO ANDRADE | Puerto Baquerizo Moreno | — | Ordinario | 581 |
| PROGRAMA DE ALFABETIZACION | Puerto Baquerizo Moreno | — | Popular Permanente | 43 |
| UNIDAD EDUCATIVA ESPECIALIZADA CORAZONES UNIDOS | Puerto Baquerizo Moreno | — | Educación Especial | 9 |
| UNIDAD EDUCATIVA IGNACIO HERNANDEZ | Puerto Baquerizo Moreno | — | Ordinario | 252 |
| UNIDAD EDUCATIVA SAN CRISTOBAL | Puerto Baquerizo Moreno | — | Ordinario | 851 |
| CORNELIO IZQUIERDO | Puerto Villamil | — | Ordinario | 313 |
| DON BOSCO DEL GUAYAS | Puerto Villamil | — | Popular Permanente | 9 |
| UNIDAD EDUCATIVA INMACULADA STELLA MARIS | Puerto Villamil | — | Ordinario | 572 |
| UNIDAD EDUCATIVA JACINTO GORDILLO | Puerto Villamil | — | Ordinario | 207 |
| ESCUELA DE EDUCACION BASICA DELIA IBARRA DE VELASCO | Santa Rosa | — | Ordinario | 54 |
| ESCUELA DE EDUCACION BASICA ODILO AGUILAR | Tomas De Berlanga | — | Ordinario | 30 |
| MENTOR GAMBOA | Tomas De Berlanga (Santo Tomas) | — | Ordinario | 7 |